Δεκαπέντε μεταπτυχιακά προγράμματα σπουδών προκήρυξε το ΤΕΙ Κρήτης, τα οποία θα γίνουν σε συνεργασία με το Ίδρυμα Τεχνολογίας Έρευνας και σχολές του Πανεπιστημίου Κρήτης. Εξ’ αυτών, τα δέκα παρέχονται δωρεάν και τα πέντε με τέλη φοίτησης.

Τα μεταπτυχιακά που προκηρύχθηκαν είναι:
1. Νανοτεχνολογία για Ενεργειακές Εφαρμογές.
2. Προηγμένη Κλινική Πρακτική στις Επιστήμες Υγείας.
3. Διοίκηση Επιχειρήσεων Φιλοξενίας και Τουρισμού.
4. Οργάνωση και Διοίκηση για Μηχανικούς.
5. Ενεργειακά Συστήματα
6. Τεχνολογίες Ήχου και Μουσικής.
7. Γεωπεριβαλλοντικοί πόροι και Κίνδυνοι.
8. Μηχανικών Πληροφορικής.
9. Εφαρμοσμένη Επιστήμη και Τεχνολογία στη Γεωπονία.
10. Λογιστική και Ελεγκτική, Χρηματοοικονομική Διοίκηση.
11. Προηγμένα Συστήματα Παραγωγής.
12. Αυτοματισμού και Ρομποτικής.
13. Λέιζερ, Πλάσμα και Εφαρμογές.
14. Ηλεκτρονικά Συστήματα Τηλεπικοινωνιών και Αυτοματισμών.
15. Επιστήμες και Μηχανική Περιβάλλοντος.